Играем в Судоку - делаем революцию в генетике

Ученые пришли к сенсационному открытию: популярная азиатская головоломка помогает ускорить секвенирование генов.

Под секвенированием понимается совокупность методов расшифровки нуклеотидной последовательности ДНК/РНК.

Американские генетики из Cold Spring Harbor Laboratory нашли оригинальный способ, позво-ляющий использовать игру Cудоку с целью секвенирования более чем 100 тысяч образцов ДНК.

В настоящее время любые лаборатории способны секвенировать одномоментно только одну-единственную последовательность.

По мнению ученых-новаторов, предложенное ими - не только новый способ сэкономить время и повысить эффективность исследования, но и путь значительного снижения финансовых затрат.

Сегодня любой проект секвенирования, полагающийся на обычные методы, стоит 10 млн долларов США. Но эту баснословную цифру можно сократить до 80 тысяч долларов или даже меньше если использовать новый Судоку-метод, убеждены первооткрыватели.

Отчет об этом интереснейшем исследовании был опубликован в издании Genome Research под оригинальным названием “DNA Sudoku—harnessing high-throughput sequencing for multiplexed specimen analysis” [Blogs.discovery.com].

Комбинируя 2000-летнюю китайскую математическую теорему с понятиями из криптологии, ученые из Cold Spring Harbor Laboratory придумали «ДНК Судоку».

"Новооткрытая уникальная стратегия позволяет скомбинировать десятки тысяч образцов ДНК, а их последовательности – порядок в котором "буквы" ДНК-"алфавита" (A, T, G и C) выстраиваются в геноме – можно определить всего за один раз".

"Теоретически, использовать Судоку-метод для определения последовательности более чем ста тысяч образцов ДНК вполне реально", - уверен профессор Грегори Хэннон, специалист в области биотехнологий и руководитель команды, которая придумала Судоку-подход [Cold Spring Harbor Laboratory].

К сведению, судоку - это головоломка-пазл с числами. У судоку есть всего одно правило. Не-обходимо заполнить свободные клетки цифрами от 1 до 9 так, чтобы в каждой строке, в каждом столбце и в каждом малом квадрате 3x3 каждая цифра встречалась бы только один раз. Правильно составленная головоломка имеет только одно решение [Википедия].

Источник: www.mk.ru

Ещё в разделе

Ученые обнаружили ген ожирения

Ученые обнаружили ген ожирения

Обнаружен новый ген ожирения, который проявляет наибольшую активность прежде всего в мозговых клетках

Ученые поняли, почему люди болеют раком чаще, чем обезьяны

Ученые поняли, почему люди болеют раком чаще, чем обезьяны

Более высокий риск раковых заболеваний у человека по сравнению с остальными приматами связан с развитием большого объема головного мозга, появление которого потребовало ослабления функций организма по программируемому уничтожению поврежденных и раковых

Животные научились использовать ДНК в качестве прибора ночного видения

Животные научились использовать ДНК в качестве прибора ночного видения

Ученые обнаружили, что ДНК в клетках сетчатки ночных животных упакована таким образом, чтобы наиболее эффективно фокусировать свет

Робот-ученый совершил первое открытие

Робот-ученый совершил первое открытие

Полностью автоматизированная система смогла провести полноценное генетическое исследование без участия человека. Создатели робота-ученого под названием "Адам" (Adam) опубликовали свои результаты в журнале Science

Генетики подсчитали: дальневосточных леопардов осталось ровно 37

Генетики подсчитали: дальневосточных леопардов осталось ровно 37

Генетики сообщили новые данные о популяции дальневосточного леопарда. Результаты численности редкой краснокнижной кошки стали известны по анализу ДНК: ученым

Березка “Долли”

Березка “Долли”

Клонировать можно не только овец. Это с успехом доказали ученые пущинского Института биоорганической химии, которые выращивают клоны деревьев.

Все ДНК опознают

Все ДНК опознают

Группа ученых из Судебно-медицинской службы (Forensic Science Service), Великобритания, разработала методику под названием «DNA Boost», позволяющую определить ДНК, даже если образцы смешанные, то есть содержат ДНК нескольких людей одновременно

Создан генетический метод определения цвета глаз преступника

Создан генетический метод определения цвета глаз преступника

Голландские учёные из медицинского центра университета Эрасмуса (Erasmus MC) разработали тест, который позволяет определить цвет глаз человека по его ДНК с точностью 90%. По крайней мере для голландцев.

У тасманийских дьяволов нашли генетическую предрасположенность к вирусному раку

У тасманийских дьяволов нашли генетическую предрасположенность к вирусному раку

Ученым удалось обнаружить генетическую предрасположенность к устойчивости некоторых особей тасманийских дьяволов к вирусному раку DFTD

Наездники подавляют иммунную защиту своих жертв при помощи прирученных вирусов

Наездники подавляют иммунную защиту своих жертв при помощи прирученных вирусов

Многие наездники вводят в тела своих жертв «вирусоподобные частицы», которые помогают личинкам паразита подавить иммунную защиту хозяина

Решена одна из величайших загадок биологии

Решена одна из величайших загадок биологии

Международная группа ученых впервые обнаружила механизм, который контролирует репликацию (удвоение) молекулы ДНК.

Ген кролика помог комнатному растению эффективней очищать воздух

Ген кролика помог комнатному растению эффективней очищать воздух

Ученые из Вашингтонского университета установили, что ген кролика, вставленный в геном комнатного растения, значительно увеличивает его способность поглощать из воздуха вредные для здоровья примести: бензол и хлороформ.

Способны ли клеточные органеллы нагреваться?

Способны ли клеточные органеллы нагреваться?

Группа ученых, в которую вошли представители из нескольких стран смогли осуществить сложный эксперимент. Речь идет об измерении температуры митохондрий в живой клетке. Результаты исследования показали, что температура органелл в процессе работы составляет 50 градусов.

Растения, словно люди, способны устанавливать приоритеты

Растения, словно люди, способны устанавливать приоритеты

Результаты нового исследования показали, что растения, в случае нападения вредителей в первую очередь защищают цветки, а не листья, как было принято считать до настоящего момента. Кроме того, также стало известно, что при одновременном нападении гусениц, тли и патогенных бактерий, главным врагом по определению растения становится гусеница и, именно против нее, прежде всего, активируются защитные механизмы.

Первый полусинтетический организм – миф или реальность

Первый полусинтетический организм – миф или реальность

Научным сотрудникам из института Scripps удалось осуществить уникальный эксперимент. Суть исследования состояла в создании новых нуклеиновых оснований с дальнейшим их вживлением в ДНК. В результате проведения эксперимента генетики создали первую в мире полусинтетическую бактерию.

Теперь и аллигаторы смогут летать

Теперь и аллигаторы смогут летать

Благодаря длительным исследованиям ученые смогли определить гены, которые отвечают за формирование чешуи у рептилий и перьев у птиц. Полученная информация дала возможность вырастить эмбрионы аллигатора с измененными внешними покровами. Конечно, достигнуть положительного результата удалось только при посредстве генетических манипуляций.

В теле нематод выявили уникальный ген

В теле нематод выявили уникальный ген

Специалисты из Калифорнийского университета выяснили, что в нематодах Caenorhabditis elegans присутствует ген, несущий ответственность за кодирование вредного для червя токсина. Ген не считается полезным для червя и не исчезает в процессе естественного отбора, так как отвечает еще и за синтез противоядия, которое необходимо для выживания потомства в теле матери.

Найдены новые микроорганизмы с новым механизмом адаптации

Найдены новые микроорганизмы с новым механизмом адаптации

Американские ученые смогли обнаружить ряд ранее неизвестных организмов, которые постоянно мутируют. Склонность к постоянной мутации зависит от генетического механизма, называемого регенерирующим разнообразием ретроэлемента.

Генетики раскрыли механизм эволюции бактерий

Генетики раскрыли механизм эволюции бактерий

Ученые из Института Броуда и Гарвардского университета смогли найти мутации, которые стимулируют появление бактерий с уникальными свойствами. В частности речь идет об устойчивости к антибиотикам разного типа. Более того, такая устойчивость позволяет микроорганизмам провоцировать неизлечимые патологии.

Американцы создали асоциальных муравьев

Американцы создали асоциальных муравьев

Американские ученые из Рокфеллеровского университета смогли создать уникальных муравьев. В частности речь идет о генетически модифицированных насекомых, которые избегают своих сородичей. Благодаря своему творению, исследователи выяснили, что взаимодействие муравьев между собой, а затем дальнейшее формирование колонии происходит при посредстве обонятельных рецепторов, находящихся в усиках.

Оценка:

Пока комментариев нет